江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達量與肉質性狀關聯(lián)性分析

      解耦聯(lián)蛋白(uncoupling protein, UCPs)是線粒體上的質子載體，以質子漏方式把H+從外膜傳遞到內(nèi)膜(Ricquier, Frédéric, 2000)。在氧化磷酸化過程中，可以降低膜內(nèi)外的電化學梯度，在電子傳遞過程中實現(xiàn)質子回流，從而起到讓呼吸鏈與ATP合成過程解耦聯(lián)的作用，使能量以熱能的形式散發(fā)，氧化磷酸化合成ATP 的效率下降(張雷等, 2010)。UCP3 基因是UCPs 家族成員之一，與UCP2 基因緊密連鎖并定位于豬的9 號染色體(Stone et al.,2015)。當受到脂肪酸刺激時，UCP3 基因表達量上調，且UCP3 蛋白參與脂肪酸和其他陰離子跨膜轉運(Lapice et al., 2017)。UCP3 活性對脂肪酸氧化和氨基酸代謝及其相關的生化途徑具有重要調節(jié)作用(Aguer et al., 2016)。所以，很多畜禽研究者將其作為一個影響肉品質的重要功能候選基因展開研究。方美英等(2002)在對豬(Sus scrofa) UCP3 基因多態(tài)性的研究中，在內(nèi)含子3 發(fā)現(xiàn)了T272G變異位點。李艷華等(2006)分析了長白豬、杜洛克等5個國內(nèi)外豬種UCP3 基因的多態(tài)位點，發(fā)現(xiàn)位于啟動子區(qū)的SNPs位點會造成轉錄因子結合位點的改變，影響對UCP3 基因的轉錄和調控，從而影響豬的生產(chǎn)性能。陳哲(2011)在UCP3 基因cDNA上檢測到A448G突變位點，并發(fā)現(xiàn)該位點等位基因A對于改善豬脂肪性狀具有積極作用。王陽等(2011)研究發(fā)現(xiàn)UCP3 參與豬骨骼肌細胞脂肪代謝的調節(jié)，從而影響地方豬種的肉質和其他性狀。但是關于UCP3 基因表達量與肉質性能之間的相關性尚未見研究報道。

      本研究以貴州優(yōu)良地方品種江口蘿卜豬為實驗材料，屠宰后測定其11 項主要肉質性能指標，并提取背最長肌中的基因組DNA建立混合DNA池，擴增UCP3 基因全部外顯子并測序，初步篩選多態(tài)位點，然后以單個樣本DNA為模板，擴增篩選到的位點對應外顯子，用以測序驗證并分型。對應肉質指標，對不同基因型豬進行肉質性能差異分析。提取背最長肌總RNA，檢測不同基因型江口蘿卜豬背最長肌中UCP3 基因的平均表達量做差異顯著性分析，分析基因型、表達量與及肉質性能三者之間的關聯(lián)性，以期探尋UCP3 基因多態(tài)性對江口蘿卜豬肉質性能的影響，為科學的選種選育提供基礎材料。